Cụ thể, bé P.P. (4 tuổi, huyện Long Thành) khởi phát bệnh vào ngày 11/6 với các triệu chứng sốt cao, mệt, đau bụng, nôn, li bì. Khi khám tại phòng mạch tư bé P. được chẩn đoán viêm đường ruột. Sau khi uống thuốc, triệu chứng của trẻ vẫn không giảm.
Ngày 13/6, bé P. đi khám lại, tiếp tục được chẩn đoán mắc viêm đường ruột. Một ngày sau, trẻ mệt hơn, ói nhiều, đau đầu, được gia đình đưa đi khám và nhập viện tại Bệnh viện Nhi đồng 2. Tại đây, bệnh nhi được lấy mẫu xét nghiệm Mac-Elisa dịch não tủy và có kết quả dương tính với virus viêm não Nhật Bản. Đến ngày 24/6, bé được xuất viện. Gia đình cho hay bé P. chưa được tiêm vaccine viêm não Nhật Bản và các loại vaccine khác.